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精確三維定位,實(shí)現(xiàn)EM成像——掌握精髓

更新時(shí)間:2022-11-29      點(diǎn)擊次數(shù):1439

使用簡(jiǎn)化的Coral Cryo電子斷層掃描工作流程確保成功

低溫電子斷層掃描(CryoET)是一種成像技術(shù),可以讓研究人員以亞納米分辨率觀察蛋白質(zhì)和其他大生物分子。了解分子的形狀和結(jié)構(gòu),包括口袋和裂隙,可以幫助研究人員設(shè)計(jì)能夠像拼圖一樣附著于分子的藥物。低溫ET成像也因此成為了解和治療疾病和失調(diào)的重要基礎(chǔ)。

了解徠卡顯微系統(tǒng)的無(wú)縫冷凍電子斷層掃描流程Coral Cryo如何使用共聚焦超分辨率更精確地定位您的意向結(jié)構(gòu)。利用該工作流程,您可以可靠地快速部署實(shí)驗(yàn),實(shí)現(xiàn)更好的可重復(fù)性、靈活性,并提高最終結(jié)果的準(zhǔn)確性。

冷凍電子斷層掃描(CryoET)

使用了冷凍電子斷層掃描(Cryo TEM),將在細(xì)胞環(huán)境內(nèi)觀察生物分子的分辨率提升到了1nm,達(dá)到了qian suo wei you的精度。通過(guò)這種方式,可以僅通過(guò)其形狀來(lái)識(shí)別單個(gè)蛋白質(zhì),而且無(wú)需任何標(biāo)記,甚至可以區(qū)分不同的構(gòu)象,幫助深入理解分子社會(huì)學(xué)。

CryoET成像為理解空間蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和相互作用提供了一種全新的方法,有助于解讀細(xì)胞機(jī)制并應(yīng)用這些見(jiàn)解。例如,它們可能有助于開(kāi)發(fā)多種疾病的治療方法。

但是,亞納米分辨率的成像存在多種挑戰(zhàn):它的成本高昂,需要大量的培訓(xùn),涉及許多儀器操作,而且大多數(shù)情況下,電子顯微鏡(EM)無(wú)法選擇性地顯示目標(biāo)結(jié)構(gòu)。為確保高成功率,在工作流程的光鏡(LM)階段,需要以盡可能高的分辨率識(shí)別和定位EM成像的目標(biāo)體積。

徠卡顯微系統(tǒng)的無(wú)縫低溫電子斷層掃描工作流程Coral使用共焦超分辨率進(jìn)行精確定位。該工作流程不僅減少了樣本制備的步驟,還提高了樣本裝載和轉(zhuǎn)移的成功率,從而提高了On-Grid Lamella/CryoET工作流程的效率。

目標(biāo)坐標(biāo)以開(kāi)放格式提供給后續(xù)的FIB研磨和LM-EM關(guān)聯(lián)。因此,您可以實(shí)現(xiàn)更高的工作效率和更好的實(shí)驗(yàn)可再現(xiàn)性。這可以幫助您加速設(shè)施中的方案部署,并提高最終結(jié)果的準(zhǔn)確性。

精確的三維體積定位

STELLARIS 5低溫共聚焦顯微鏡,包括低溫平臺(tái)和轉(zhuǎn)移梭,是Coral Cryo工作流程中精確定位的核心部分。與寬視場(chǎng)儀器相比,共焦顯微鏡的Z分辨率更高,在設(shè)計(jì)上更適合三維定位。

通過(guò)在后續(xù)的高精度關(guān)聯(lián)中應(yīng)用超分辨率的數(shù)據(jù),STELLARIS 5 Cryo作為一個(gè)獨(dú)立的組件,性能優(yōu)于使用集成光鏡進(jìn)行定位的EM解決方案,同時(shí)也釋放了寶貴的EM儀器時(shí)間。

使用熒光珠在樣本上施加一個(gè)基準(zhǔn)標(biāo)記。通過(guò)確定它們?cè)谌S圖像數(shù)據(jù)中的位置,可以顯著提高Z軸上的定位精度。此外,徠卡還開(kāi)發(fā)了一種基于插值的方法,能夠以比系統(tǒng)的實(shí)際光學(xué)分辨率更高的精度找到熒光珠中心(正在申請(qǐng)zhuan li)。

LAS X Coral Cryo:基于插值的三維定位,使用X和Y方向的Z-堆棧的截面。標(biāo)記可在所有相關(guān)窗口中交互移動(dòng)。


安全完成工作流程的各個(gè)階段

STELLARIS 5 Cryo可結(jié)合先進(jìn)的CryoET定位軟件(LAS X Coral Cryo),還可以無(wú)縫集成和轉(zhuǎn)移到低溫FIB或VCT平臺(tái)。傳統(tǒng)的低溫電子斷層掃描的工作流程包含多個(gè)復(fù)雜的步驟,特別容易出錯(cuò),并經(jīng)常破壞后續(xù)重要的成像步驟。人工準(zhǔn)備、處理和轉(zhuǎn)移樣本的步驟不僅麻煩、繁瑣,還可能導(dǎo)致樣本污染或反玻璃化。

Coral Cryo的工作流程改變了這一點(diǎn)。通過(guò)簡(jiǎn)化工作流程,可以實(shí)現(xiàn)更廣泛的CryoET應(yīng)用。精簡(jiǎn)的步驟、高靈活性和安全性,可確保樣本的活力、質(zhì)量檢查,實(shí)現(xiàn)精確和可靠的三維定位機(jī)制。

低溫平臺(tái)是一個(gè)更穩(wěn)定的封閉系統(tǒng),更容易操作,且無(wú)需從平臺(tái)上取下冷卻插件。樣本轉(zhuǎn)移梭的裝載過(guò)程簡(jiǎn)單,可將樣本損失的風(fēng)險(xiǎn)降至zui di,并促進(jìn)沿儀器平臺(tái)的轉(zhuǎn)移。

STELLARIS 5 Cryo可結(jié)合先進(jìn)的冷凍電子斷層掃描定位軟件 (LAS X Coral Cryo),并與冷凍FIB或VCT階段的各種無(wú)縫集成和傳輸選件結(jié)合使用。

 Clamydomonas TauSense比例尺10µm

Coral Cryo - 工作原理

集成解決方案的優(yōu)勢(shì)

如果沒(méi)有準(zhǔn)確的目標(biāo)位置,片狀目標(biāo)區(qū)域的方法通常是一種耗時(shí)的迭代方法。與集成 LM-EM版本相比,使用Coral Cryo工作流程和STELLARIS 5 Cryo共聚焦顯微鏡可以通過(guò)共聚焦技術(shù)提供更高的分辨率,更好的圖像質(zhì)量和更高的Z分辨率。Coral Cryo為精確檢測(cè)目標(biāo)熒光提供了光譜靈活性,我們du te的TauSense技術(shù)

以消除不需要的自發(fā)熒光,并對(duì)目標(biāo)識(shí)別進(jìn)行微調(diào),在進(jìn)入EM階段之前可以預(yù)先檢查。

用TauSense成像工具檢查硅藻。光譜-500-640 nm光譜帶的強(qiáng)度圖像。TauContrast-Look-up-table表示光子的平均到達(dá)時(shí)間;短的到達(dá)時(shí)間為藍(lán)色,長(zhǎng)的到達(dá)時(shí)間由黃色過(guò)渡到紅色。顯示了不同的結(jié)構(gòu)。TauSeparation-T光譜成分被分離,成分1顯示葉綠體的自發(fā)熒光,0.1 ns;成分2顯示純凈的LifeAct-GFP信號(hào),平均到達(dá)時(shí)間2.7 ns。樣本由德國(guó)TU Dresden,B CUBE的Nicole Poulsen提供。


靈活性

Coral Cryo提供兩種不同的工作流程解決方案,為低溫FIB顯微鏡提供高靈活性。通過(guò)我們靈活的工作流程,我們的低溫傳輸系統(tǒng)EMVCT可以連接市場(chǎng)上所有的低溫FIB 解決方案,為您提供Coral Cryo工作流程的所有優(yōu)勢(shì)。對(duì)于Thermo Scientific Aquilos的用戶,我們提供集成解決方案,通過(guò)將我們的樣本盒與Aquilo低溫FIB 的硬件整合,進(jìn)一步減少工作流程的步驟。

精簡(jiǎn)的端到端Coral Cryo工作流程提供了明確的步驟、模塊和無(wú)縫的硬件和軟件接口。由于無(wú)縫的硬件和軟件接口,Coral Cryo可以快速部署在您的設(shè)施或?qū)嶒?yàn)室。

熒光結(jié)構(gòu)的三維定位用于冷凍電子斷層掃描

 

熒光結(jié)構(gòu)的三維定位用于冷凍電子斷層掃描。薄片轉(zhuǎn)移到低溫TEM上。由德國(guó)Martinsried的Max-Planck生物化學(xué)研究所的Anna Bieber和Cristina Capitanio友情提供;Stem由Florian Wilfling提供。

通過(guò)超分辨率的低溫共聚焦顯微鏡識(shí)別熒光結(jié)構(gòu)。使用樣本周圍的珠子作為相關(guān)標(biāo)記,可以在低溫FIB-SEM上識(shí)別目標(biāo)結(jié)構(gòu),并從細(xì)胞體積中磨出含有目標(biāo)結(jié)構(gòu)的薄片。薄片被轉(zhuǎn)移到低溫TEM上,記錄薄片的傾斜系列。從傾斜系列中可以計(jì)算出三維體積,其分辨率可達(dá)亞納米級(jí),并為可視化和分析創(chuàng)建一個(gè)渲染圖。

· A - 共聚焦三維體積的最大強(qiáng)度投影。目標(biāo)結(jié)構(gòu)(表達(dá)Ede1-eGFP的酵母細(xì)胞,參與凝集素介導(dǎo)的內(nèi)吞作用)由一個(gè)箭頭描述出來(lái)。

· B - FIB研磨后的TEM中的FIB片層,疊加Ede1-eGFP的熒光。

· C - 片層體積斷層圖的示例性圖像。正方形表示圖像D的位置。

· D-斷層圖的細(xì)節(jié),描繪了相分離的內(nèi)細(xì)胞蛋白沉積。

比例尺:A - 內(nèi)部網(wǎng)格方塊的寬度。90μm,條寬:35 µm.B, C, D - 插入物的邊緣長(zhǎng)度為2微米。

LNG-non-LNGHeLa細(xì)胞標(biāo)記色:深藍(lán)色-Hoechst,細(xì)胞核;綠色-MitoTracker Green,線粒體;紅色-Bodipy,脂質(zhì)滴。白色-珠子,反射模式-網(wǎng)格條。細(xì)胞由德國(guó)海德堡歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室(EMBL)Mahamid Group的Ievgeniia Zagoriy友情提供。


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